The incompleteness theorems

Mémoire défendu en vue de l'obtention du titre de Master en sciences mathématiques portant sur les théorèmes d'incomplétude et constitué de quatre chapitres : le premier est un rappel des bases en logique formelle et en théorie des fonctions récursives; le second est consacré aux théorèmes d'incomplétude de Gödel; le troisième présente un exemple détaillé d'un énoncé aisé à comprendre mais néanmoins indémontrable dans l'arithmétique de Peano; le dernier explorant les possibilités de "mesure" des théorèmes indémontrables

Collaborative analysis of multi-gigapixel imaging data using Cytomine

Motivation: Collaborative analysis of massive imaging datasets is essential to enable scientific discoveries. Results: We developed Cytomine to foster active and distributed collaboration of multidisciplinary teams for large-scale image-based studies. It uses web development methodologies and machine learning in order to readily organize, explore, share and analyze (semantically and quantitatively) multi-gigapixel imaging data over the internet. We illustrate how it has been used in several biomedical applications

SLDC: an open-source workflow for object detection in multi-gigapixel images

CYTOMINE, Histowe

Cytomine: towards an open and collaborative software platform for digital pathology bridged to molecular investigations

PURPOSE: Digital histology is being increasingly used in research and clinical applications. In parallel new tissue imaging methods (e.g. imaging mass spectrometry) are currently regarded as very promising approaches for better molecular diagnosis in pathology. However, these new data sources are still often underexploited because of the lack of collaborative software to share and correlate information for multimodal analysis. EXPERIMENTAL DESIGN: We followed the open science paradigm to develop new features in our web-based Cytomine software to support next-generation digital pathology bridged to molecular investigations. RESULTS: Our new open-source developments allow to explore whole-slide classical histology with MALDI imaging and to support preprocessing for biomarker discovery using laser microdissection-based microproteomics. CONCLUSIONS AND CLINICAL RELEVANCE: Our updated version of Cytomine is the first open and web-based tool to enable sharing data from classical histology, molecular imaging and cell counting for proteomics preprocessing. It holds good promise to fulfill imminent needs in molecular histopathology. This article is protected by copyright. All rights reserved

Vrije toegang tot juridische informatie: een democratische én budgettaire kans

Iedere maand verspreiden een vierhonderdtal juridische tijdschriften honderden artikels over de Belgische en Europese rechtspraak en wetgeving. Deze artikels worden geschreven door of in samenwerking met specialisten uit de publieke (wetgever, rechters, professoren, onderzoekers en griffiers) en privésector (advocaten, notarissen, deurwaarders en bedrijfsjuristen) en behandelen kwesties van algemeen belang, zoals de rechtsactualiteit, de uitspraken van hoven en rechtbanken, maar ook onderwerpen uit de rechtsleer

A not so harmless mass: Kaposiform hemangioendothelioma complicated by a Kasabach-Merritt phenomenon.

A vascular mass localized in the face and the neck was displayed by ultrasonography in a 38-week-old male fetus. At birth, the mass was bulky and purplish. The newborn breathed spontaneously but with severe desaturation. During laryngoscopy, we observed an obstruction of the larynx with a left-shift caused by the hemorrhagic mass. Blood analysis revealed anemia, severe thrombocytopenia, and coagulation disorders. The diagnosis of kaposiform hemangioendothelioma (KHE) complicated by a Kasabach-Merritt phenomenon (KMP) was put forward and treatment with propranolol, corticoids, and vincristine was initiated. Platelets were transfused daily for 8 days but did not resolve the thrombocytopenia. At day 8, we added sirolimus to the treatment and noted a rapid response with the normalization of the platelet count within 1 week and a significant regression of the mass. In this paper, we review the clinical and biological features of hemangioendothelioma associated with KMP and discuss its current and future treatment. Sirolimus seems to be very promising

BIAFLOWS: A Collaborative Framework to Reproducibly Deploy and Benchmark Bioimage Analysis Workflows

Peer reviewe

A MASSIVE OPEN ONELINE COURSE (MOOC) ON PRATICAL HISTOLOGY : A GOAL, A TOOL, A LARGE PUBLIC ! RETURN ON A FIRST EXPERIENCE.

Un objectif ! Le MOOC intitulé « Introduction à l’histologie, exploration des tissus du corps humain » reflète notre vision de la pratique de l’Histologie générale qui repose sur la capacité à diagnostiquer les 5 familles de tissus biologiques. A terme, les participants doivent être capables de reconnaître les différents types cellulaires et tous les éléments qui les entourent afin de comprendre comment ils s’organisent entre eux pour former des tissus aux fonctions spécifiques. Un outil ! Ce savoir-faire s’appuie sur la construction d’un raisonnement à partir d’observations de structures microscopiques. Pour ce faire, les apprenants sont invités à manipuler un microscope virtuel pour explorer des prélèvements biologiques sur lames histologiques digitalisées. Des annotations, commentaires, dessins ou photos sont associés à des repères qui enrichissent l’étude de ces coupes histologiques. Un public cible ! Deux parcours pédagogiques permettent d’approfondir différemment la matière et de correspondre ainsi aux objectifs ou motivations de chacun. Après une première année d’expérience, les statistiques d’utilisation et des sondages réalisés auprès de nos apprenants montrent que le MOOC Histo a permis à chacun d’eux d’y trouver un intérêt et de fédérer une communauté d’apprenants motivés

Ascertaining the potential of learning dashboards in histology

La communication synthétise les résultats d'un questionnaire visant à estimer les attentes d'enseignants en histologie en matière de visualisations de traces d'apprentissage laissées par leurs étudiants lorsqu'ils travaillent avec un outil spécialisé (Cytomine) permettant une interaction avec des coupes histologiques numérisées.HistoWe